- FondsJB1-JB384 - Joëlle Burnouf. Archéologies environnementales
- Série organiqueJB1-JB76 - Direction d'opérations archéologiques et de programmes de recherche
- Sous-série organiqueJB14-JB51 - Direction scientifique et technique du chantier de fouilles archéologiques préalables à la construction de la ligne D du métro à Lyon
- Sous-sous-série organiqueJB42-JB48 - Manuscrits non publiés
- DossierJB46 - « Lyon revisité »
- PièceJB47 - Manuscrit sur la ville de Tours au Moyen Âge
- PièceJB48 - « Le fait urbain médiéval : le cas de la France »