Les collections sont issues des unités de recherche de la MSH Mondes (cartothèque), des services (expositions photographiques, posters, films) ou de partenariat avec d’autres institutions comme la collection des rapports de missions archéologiques françaises à l’étranger (CEPAM Cultures - Environnements. Préhistoire, Antiquité, Moyen Âge (UMR 7264) qui rassemble les copies des rapports transmis au ministère des Affaires étrangères depuis la fin des années 1970 jusqu’au début des années 2000.
CA – Cartothèque
181 cartes d’Afghanistan (1958-1968) ; 157 cartes du Proche-Orient (1920-1957) dont les relevés datent principalement des années 1940-1945.
MAFE - Rapports de missions archéologiques françaises à l'étranger
Environ 3400 rapports de Missions archéologiques françaises à l’étranger conduites sur les 5 continents, entre 1978 et 2006.
PM – Expositions de la Maison René-Ginouvès, Archéologie et Ethnologie
Près de 1000 photographies et 100 posters en ligne, issus de 27 expositions de photographies et de posters scientifiques réalisées par les archéologues, les ethnologues et le service Arts graphiques et multimédia de la MAE entre 2000 et 2012.