- FondsJB1-JB384 - Joëlle Burnouf. Archéologies environnementales
- Série organiqueJB1-JB76 - Direction d'opérations archéologiques et de programmes de recherche
- Sous-série organiqueJB66-JB76 - Direction du programme « Interaction Sociétés / Milieux dans le bassin versant de la Loire depuis le Tardiglaciaire jusqu'à l'époque industrielle »
- Sous-sous-série organiqueJB66-JB69 - Direction générale du projet
- DossierJB66 - Documentation
- DossierJB67 - Années 1995-1997
- DossierJB68 - Années 1999-2001
- DossierJB69 - Années 2002-2004