- FondsJB1-JB384 - Joëlle Burnouf. Archéologies environnementales
- Série organiqueJB1-JB76 - Direction d'opérations archéologiques et de programmes de recherche
- Sous-série organiqueJB14-JB51 - Direction scientifique et technique du chantier de fouilles archéologiques préalables à la construction de la ligne D du métro à Lyon
- Sous-sous-série organiqueJB42-JB48 - Manuscrits non publiés
- DossierJB44-JB45 - Lyon-Vaise : les fouilles du site de Gorge de Loup à Vaise, les données archéologiques : interactions de l’homme et du milieu au débouché du vallon de Trion à l’âge des métaux (1935-425 avant notre ère)
- Sous-dossierJB44 - Années 1990-1995
- Sous-dossierJB45 - Années 1996-1999